新華社深圳10月17日電(記者陳宇軒、毛思倩)記者17日從中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所了解到,科研人員成功繪制了基于一萬(wàn)余份水稻樣本的群體變異圖譜,這意味著水稻育種從此有了萬(wàn)份級(jí)樣本的“數(shù)字地圖”,為進(jìn)一步研究水稻基因的自然變異尤其是稀有變異提供了強(qiáng)有力的工具。
水稻是全球最重要的糧食作物之一,其基因組的自然變異是基因改良和現(xiàn)代育種的重要遺傳基礎(chǔ)。因此,要提升水稻育種水平,就必須在大規(guī)模的水稻群體中鑒定出自然變異,并進(jìn)一步挖掘其中的稀有變異及其潛在應(yīng)用。
研究負(fù)責(zé)人、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研究員商連光表示,科研人員以水稻超級(jí)泛基因組為依據(jù),對(duì)10548份水稻樣本進(jìn)行了自然變異分類(lèi),構(gòu)建了水稻超大規(guī)模的群體基因組變異數(shù)據(jù)集,這就像一張水稻研究的“數(shù)字地圖”,為育種提供了清晰的指引。
借助“數(shù)字地圖”的幫助,科研人員在水稻育種方面取得了新的突破:一方面糾正了部分水稻秈粳分類(lèi)上的錯(cuò)誤;另一方面廣泛分析了重要功能基因在不同亞群中的群體頻率,鑒定了其中的優(yōu)異自然變異。
以此為基礎(chǔ),科研人員還建立了面向全球用戶的在線數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái),為水稻研究提供了單倍型整合分析、變異圖譜分析、系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析等科研服務(wù),進(jìn)一步提升了我國(guó)在全球水稻研究領(lǐng)域的學(xué)術(shù)地位。
該研究由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所、崖州灣實(shí)驗(yàn)室、中國(guó)水稻研究所、河南大學(xué)等單位共同完成。相關(guān)研究成果近日發(fā)表于國(guó)際權(quán)威期刊《核酸研究》。
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